Reading...
Play button
Play button
Use LEFT and RIGHT arrow keys to navigate between flashcards;
Use UP and DOWN arrow keys to flip the card;
H to show hint;
A reads text to speech;
42 Cards in this Set
- Front
- Back
|
Nukleinsyrer
|
Adenin, Thymin, Cytosin, Guanin
|
|
|
Replication origins
|
områder på kromosom hvor replikation initieres. Mange A-T, da disse kun er bundet til hinanden to steder.
|
|
|
Leading strand
|
Ene del af DNA-molekylet, der polymeriseres på én gang. 3' til 5' delen.
|
|
|
Lagging strand
|
Ene del af DNA-molekylet, der polymeriseres ved sammensætning af flere mindre DNA-fragmenter (Okazzagi fragmenter). Bindes sammen af DNA-ligase. 5' til 3' delen.
|
|
|
Proof-reading mekanismer
|
1. Korrekt nukleotid har større affinitet for DNA-polymerase pga. baseparring.
2. DNA-polymerase undergår konformationsændring ved binding af nukleotid. 3. 3' til 5' proof-reading exonuclease |
|
|
Replikationsgafflen
|
Det kompleks, der sørger for replikation af DNA. DNA-helicase, DNA-primase (bundet til DNA polymerase-alpha som subunit), DNA-polymerase (alpha og delta), Single-strand-binding-proteine, clamp
|
|
|
DNA-helicase
|
Spalter dobbeltstrengen under forbrug af ATP
|
|
|
DNA-ligase
|
Hæfter Okazzagi fragmenter sammen.
|
|
|
DNA-polymerase-alpha
|
kun hos euk: står for dannelse af RNA-primer og den første polymerisering. Har en primase som subunit.
|
|
|
DNA-polymerase-delta
|
kun hos euk: fortsætter polymerisering efter DNA-polymerase-alpha har påbegyndt polymeriseringen.
|
|
|
Primosom
|
kun hos prokar: kompleks bestående af DNA-helicase og DNA-primase
|
|
|
Clamp + clamploader
|
Binder DNA-polymerasen til DNA-streng
|
|
|
Single-strand-binding-protein
|
Glatter lagging strand ud. Sørger for at de to spaltede strenge ikke polymeriserer igen.
|
|
|
Strand direct mismatch repair
|
mismatch binding protein finder mismatch og finder herefter et område der er "nicket" (hul i streng) -> streng fjernes -> DNA-polymerase sætter ny streng på.
|
|
|
DNA topoisomerase
|
Forhindrer DNA-dobbelthelix i at snøre sig sammen og umuliggøre transkription. Kløver backbone.
|
|
|
Depurination
|
Skade i DNA hvor en purine (adenin, guanin) fjernes.
|
|
|
Primosom
|
kun hos prokar: kompleks bestående af DNA-helicase og DNA-primase
|
|
|
Deamination
|
Ændring af en nitrogenholdig base. Eks fra cytosin til uracil med tilførsen af H2O og fraspaltning af NH3.
|
|
|
Clamp + clamploader
|
Binder DNA-polymerasen til DNA-streng
|
|
|
Base excision repair
|
Rettelse af mindre fejl:En glycosylase scanner DNA og fejl flippes ud -> AP endonuclease fjerner fosfat-back-bone og fosfordiesterase fjerner fosfat -> DNA-polymerase påsætter korrekt nukleotid, DNA-ligase limer sammen
|
|
|
Single-strand-binding-protein
|
Glatter lagging strand ud. Sørger for at de to spaltede strenge ikke polymeriserer igen.
|
|
|
Nukleotid excision repair
|
Rettelse af større fejl: Nuclease klipper på begge sider af fejl -> DNA-helicase klipper op -> DNA-polymerase og ligase laver og limer.
|
|
|
Strand direct mismatch repair
|
mismatch binding protein finder mismatch og finder herefter et område der er "nicket" (hul i streng) -> streng fjernes -> DNA-polymerase sætter ny streng på.
|
|
|
DNA topoisomerase
|
Forhindrer DNA-dobbelthelix i at snøre sig sammen og umuliggøre transkription. Kløver backbone.
|
|
|
non-homologous end-joining
|
Ved dobbeltbrud: de to dele klippes til, så de kan sættes sammen igen af ligase. Information går tabt.
|
|
|
Depurination
|
Skade i DNA hvor en purine (adenin, guanin) fjernes.
|
|
|
Deamination
|
Ændring af en nitrogenholdig base. Eks fra cytosin til uracil med tilførsen af H2O og fraspaltning af NH3.
|
|
|
Base excision repair
|
Rettelse af mindre fejl:En glycosylase scanner DNA og fejl flippes ud -> AP endonuclease fjerner fosfat-back-bone og fosfordiesterase fjerner fosfat -> DNA-polymerase påsætter korrekt nukleotid, DNA-ligase limer sammen
|
|
|
Nukleotid excision repair
|
Rettelse af større fejl: Nuclease klipper på begge sider af fejl -> DNA-helicase klipper op -> DNA-polymerase og ligase laver og limer.
|
|
|
non-homologous end-joining
|
Ved dobbeltbrud: de to dele klippes til, så de kan sættes sammen igen af ligase. Information går tabt.
|
|
|
Sigma-factor
|
prokaryot: binder til RNA-polym. og søger efter promotor-sekvens på DNA. Dissocierer efter DNA-sekvensen er fundet.
|
|
|
Promotor- og terminator-sekvens i prok.
|
Start og slut til RNA-polym. Konsensussekvens.
|
|
|
Transkriptionsinitiering hos euk
|
Kræver tilstedeværelse af:
- generelle transkriptionsfaktorers (TFII'ere). Kan sammenlignes med sigma-factor hos prok. - activator, hjælper TFII og polym. med at binde til DNA. |
|
|
Elongeringsfaktorer ved transkription
|
Sørger for, at polym. ikke dissocierer fra DNA under polymerisering (gælder for både pro og eu).
|
|
|
RNA-processing ved transkription hos eukaryoter
|
splicing, capping og polyadenylering. Forbundet med transkriptionselongering
|
|
|
Capping
|
Påsættelse af methyleret guanin i 5'enden. Vigtig ved genkendelse af mRNA. RNA polymerase II er den eneste, der har denne funktion.
|
|
|
Splicing
|
adenin-nukleotid angriber fosfat-back-bone og skaber en lasso således at intron fjernes og 3' ende på exon 1 sættes sammen med 5' ende på exon 2. Foretages af spliceosom (snRNA + protein).
|
|
|
Polyadenylering
|
Påsætning af A'ere på 3' enden. Gør binding af poly-a-bindende proteiner. Udføres af poly-A-polymerase (PAP)
|
|
|
Nuclear pore complex (NPC)
|
Huller i kernemembran. Passage af mRNA.
|
|
|
RNA polymerase I
|
5,8S, 18S og 28S rRNA gener
|
|
|
RNA polymerase II
|
Alle proteinkodende gener, snoRNA gener og snRNA gener.
|
|
|
RNA polymerase III
|
tRNA gener, snRNA gener og andre små RNA gener.
|
