Use LEFT and RIGHT arrow keys to navigate between flashcards;
Use UP and DOWN arrow keys to flip the card;
H to show hint;
A reads text to speech;
23 Cards in this Set
- Front
- Back
|
Vad är en chelator, typ EDTA? |
Binder till & avlägsnar metalljoner så att enzymaktivitet förloras. |
|
|
Vad innebär "induced fit"? |
Ngt binder in som gör att substratet passar bättre på den aktiva ytan. |
|
|
Vad innebär kovalent katalys? |
Substrat som är kovalent bundet (bildas & bryts) till grupp på aktiva ytan. Ofta stark nukleofil (donerar e-). |
|
|
Vad innebär generell syra/bas-katalys? |
Molekyl annan än H2O donerar/accepterar proton från substrat. |
|
|
Vad är proteaser? Vilken reaktion katalyserar ett proteas? |
Bryter ner proteiner i kroppen så att kroppen ska kunna utbyttja as & bygga nya proteiner. Katalyserar klyvningen av en peptidbindning i en polypeptidkedja. |
|
|
Var bildas chymotrypsin? Var klyver det? |
Bildas i pancreas som chymotrypsinogen vilket klyvs av trypsin till chymotrypsin i duodenum. Specifik klyvningsposition: karboxylsidan om stora hydrofoba (grupper?) |
|
|
Mekanism för chymotrypsin? |
Nukleofil attack av Ser på peptidkedjans karbonylkol, kovalent bundet tetrahedraltintermediat, bildning av acyl‐enzym, aminen lämnar, en vattenmolekyl bildar stark nukleofilmha histidinen, nukleofil attack av OH‐ på karbonylkolet ger nytt tetrahedralt intermediat,karboxylsyran lämnar. |
|
|
Vilka aminosyror består den katalytiska triaden hos chymotrypsin av och vilka olika uppgifter har de? |
His, Ser & Asp. De spelar en viktig roll vid klyvning av proteaser. His: (agerar bas) polariserar Ser, drar till sig proton från Ser (Ser blir bättre nukleofil än normalt). Ser: utför den nukleofila attacken. Asp: orienterar His rätt så den kan utföra sitt jobb. |
|
|
Vad specificerar proteaser? |
Specificiteten bestäms av 3D-struktur i enzymets fickor. Rätt substrat har sidokedjor som passar i fickorna. |
|
|
Vad är gemensamt för alla proteaser? |
Aktiverar en H2O eller annan nukleofil. Polariserar karbonyl Stabiliserar intermediatet |
|
|
Nämn fyra grundläggande katalytiska strategier och beskriv kort hur de fungerar. |
Kovalent katalys: substratet blir kovalent bundet till en grupp på den aktiva ytan. Generell syra-bas katalys: en molekyl annan än vatten donerar eller accepterar en protontill/från substratet. Katalys genom närhet (approximering): två substrat förs nära varandra på sammabindningsyta. Metalljonskatalys: metalljoners kemiska egenskaper används i katalysen. (ex. karbanhydras) |
|
|
Nämn en katalytisk strategi som a) karbanhydras använder sig av b) chymotrypsin använder sig av |
a) Metalljonskatalys b) Kovalent katalys eller generell syra-bas katalys |
|
|
Ett cysteinproteas har en histidin och en cystein i sin aktiva yta. Vilka uppgifter har dessa bådaaminosyror? |
Cystein: utför den nukleofila attacken. Histidin: drar till sig en proton från cysteinen (generellbaskatalys). b) |
|
|
Beskriv karbanhydras reaktionsmekanism. |
En vattenmolekyl bunden till zinkjonen i karbanhydras aktiva yta deprotoneras till en hydroxidjon. Hydroxidjonen utför en nukleofil attack på koldioxidmolekylen. En bikarbonatjon bildas därmed som frigörs och en ny vattenmolekyl binder in till aktiva ytan. |
|
|
Vad har zinkjonen i karbanhydras för uppgift? |
Sänker vattnets pKa och gör det till en kraftfull nukleofil (och stabiliserar den negativaladdningen på vätekarbonatintermediären). |
|
a) Vilken reaktion katalyseras av enzymet vars aktiva yta syns på bilden b) Vilket intermediärt tillstånd i reaktionen syns på bilden? c) Hur stabiliseras detta tillstånd av enzymet? d) Vilket enzym kan det vara som utför reaktionen ovan? |
a) Klyvning av en peptidbinding. b) (Kovalent bundet) tetrahedralt intermediat. c) Av oxyanjonhålet, positiva laddningar runt en ficka i enzymet. d) Chymotrypsin alt. ett serinproteas. |
|
|
Nämn fyra typer av proteaser. |
Serinproteas Metalloproteas Cysteinproteas Aspartylproteas |
|
|
Du skapar två muterade varianter av proteinet chymotrypsin. I variant A har serinen i den katalytiska triaden muterats till en alanin och i variant B har serinen i stället muterats till en cystein. Vilken variant tror du har högst katalytiska aktivitet och varför?
Vad har chymotrypsin för uppgift i kroppen och var någonstans är det aktivt? |
Variant B eftersom cysteinen kan agera nukleofil i reaktionen i stället för serinen. Bryter ner proteiner från födan till aminosyror i tolvfingertarmen |
|
|
Enzymet karbanhydras är ett av de snabbaste vi känner till. Vilken komponent måste ingå i lösningen för att den högsta hastigheten ska uppnås och vad har den komponenten för uppgift? |
Buffert; för att ta hand om protonerna som frigörs (pH och protonernas diffusionshastighetbegränsar annars). |
|
|
a) Vilken reaktion katalyserar karbanhydras? b) Viken är den kraftfulla nukleofilen i karbanhydras? |
a) Hydrering/dehydrering av CO2. b) Hydroxidjon bunden till zink. |
|
|
Under chymotrypsins klyvning av en peptidkedja sker det två nukleofila attacker. Vilkagrupper är det som utför dem? |
Deprotonerade serinen och en vattenmolekyl (OH‐) |
|
|
Längst ner i specificitetsfickan på ett visst serinproteas sitter en asparaginsyra. Vilken effekt tror du det får på proteasets specificitet om asparaginsyran muteras till en lysin (Asp → Lys)? |
Specificiteten ändras från positivt laddade till negativt laddade aminosyror.
|
|
|
Vilka uppgifter har de fyra viktigaste histidinerna i karbanhydras? |
Tre histidiner koordinerar zinkjonen & en är protonskyttel ut till lösning. |
