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115 Cards in this Set
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Stopcodon "amber"
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UAG
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codiert Pyl
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Stopcodon "ochre"
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UAA
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Stopcondon "opal"
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UGA
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codiert Sec
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Anzahl der Enzyme im Menschen
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50 000 bis 70 000
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Selenocystein
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Sec, U
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Codon: opal UGA
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essentielle Aminosäuren
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I, L, K, M, F, W, Y, V
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semiessentielle Aminosäuren
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R, H
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Präbiotische Glycinsynthese
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Amidomalonat-Synthese (D)
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Instabilität von β-Oxocarbonsäuren gegenüber Decarboxylierung: 6-Elektronen-Decarboxylierung
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Alaninsynthese über reduktive Aminierung
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Edukt: Brenztraubensäure bzw. Pyruvat
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Strecker-Synthese
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Enantioselektive Aminosäuresynthese
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L-DOPA
William Knowles (Monsanto), NP 2001 |
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Pyrrolysin
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Pyl, O
Codon: amber UAG |
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Anzahl der Kinasen im menschlichen Organismus
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ca. 500
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Arten von Proteinphosphorylierung im Menschen
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pS, pT, pY
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zusätzliche Phosphorylierungsarten in Bakterien und Pilzen
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pH, pD
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ΔH (Proteinphosphorylierung)
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-30 kJ/mol
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häufigste Arten der Protein-N-Acylierung
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Acetylierung, Myristoylierung, Palmitoylierung, Ubiquitinierung
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Myristinsäure
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Tetradecansäure
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Lipidanker
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Anzahl der Aminosäuren und Masse von Ubiquitin
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76 AS, 8.6 kDa
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Mechanismus der Ubiquitinierung
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K48 -> Proteasom
K63 -> Lysosom |
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Aktivierung von Acylierungsmitteln
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ΔH(Pyrophosphat-Hydrolyse)
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-19.22 kJ/mol
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Pantothensäure
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Pantoinsäure
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SAH
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S-Adenosylhomocystein
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SAM
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S-Adenosylmethionin
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Syntheseort der Glycaneinheiten zur Proteinglycosylierung
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Endoplasmatisches Reticulum
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UDP-Glucose
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Typen von Glycosyltransferasen
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inverting
retaining |
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Glykan
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Polysaccharid
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Glycosid
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Glykon + Aglykon
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Häufigkeit verschiedener Glykosylproteine
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N-Glycosylproteine (an N) häufiger als O-Glycosylproteine
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Kapsel oder Schleimhülle eukaryotischer Zellen
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Glykokalyx
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N-Acetylneuraminsäure
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aus ManNAc-6-P und PEP durch Aldolase (Sialinsäure-9-Phosphat-Synthase)
eine Sialinsäure bzw. Sialsäure |
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Staudinger-Reaktion
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Staudinger-Ligation
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Carolyn R. Bertozzi (Berkeley)
Nachteil: relativ langsam |
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Carbalkoxygruppe
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"Traceless" Staudinger-Ligation
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Huisgen-Cycloaddition
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Kupferkatalysierte Huisgen-Cycloaddition
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1,4-regioselektiv
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kupferfreie Huisgen-Cycloaddition unter physiologischen Bedingungen
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Ras
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von rat sarcoma; sog. kleines G-Protein (GTPase)
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Maleimid-Michael-Addition
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spezifisch für Thiolreste
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Native chemische Ligation
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auch Expressed Protein Ligation
Bedingungen: C-terminaler Thioester; N-terminales Cystein |
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Boc₂O
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Di-tert-butyldicarbonat
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Abspaltung von Boc
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Säuren, i.d.R. TFA
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u.U. Einsatz von Scavengern für das tert-Butylkation nötig
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Abspaltung von Fmoc
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Basen, z.B. sekundäre Amine wie Piperidin
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Seitenketten-Schutzgruppen für S, T, Y, D, E
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tert-Butyl, Benzyl
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Seitenketten-Schutzgruppen für C
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Trityl, Acetamidomethyl Acm (Boc-orthogonal)
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Probleme bei der Carbodiimid-Kupplung
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N-Acylharnstoffbildung
Oxazolonbildung und Racemisierung |
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Probleme bei der Peptidsynthese mit Synthesizer
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Agglomeratbildung mancher Sequenzen, schlechtere Kuppelbarkeit mancher AS
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BOP
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Benzotriazole-1-yl-oxy-tris-(dimethylamino)-phosphonium hexafluorophosphate
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pyBOP
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(Benzotriazol-1-yloxy)tripyrrolidinophosphonium hexafluorophosphate
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pyBroP
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BroP
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HBTU
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HATU
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Ninhydrin-Test
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Kaiser-Test
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Kaliumcyanid in einer wässrigen Pyridin-Lösung
Ninhydrin in n-Butanol oder Ethanol Phenol in n-Butanol oder Ethanol |
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Ruhemanns Violett (~ Blau, ~ Purpur)
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Coenzym A
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Protein Splicing
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Synthese C-terminaler Thioester
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Protein-Transspleißen
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Mechanismus von Kinasen
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ATP-Bindetasche und Lysinreste hoch konserviert
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Lipinski's Rule of Five
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Aufklärung des Substrats einer Kinase
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Mechanismus von PTPs
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PTP-Inhibitoren
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mechanismusbasierter PTP-Inhibitor
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Protease, bei der das aktive Zentrum durch ein Propeptid blockiert ist
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Zymogen
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Mechanismus der Serinproteasen
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Serinprotease-Inhibitoren
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Penicillin G
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Proteasom-Aktivierung
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Proteasom-Mechanismus
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Mechanismus der Cystein-Proteasen
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Cystein-Protease-Inhibitoren 1
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Cystein-Protease-Inhibitoren 2
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Cystein-Protease-Inhibitoren 3
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Mechanismus der Aspartat-Proteasen
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Mechanismus von Metalloproteasen
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Inhibitoren für Matrix-Metalloproteasen
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Prinzip vom ABPP
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TCEP
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Irreversibel bindende Sonden für ABPP
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ABPP-Sonden für Metalloproteasen
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ABPP-Sonden für Aspartatproteasen
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verschiedene Photocrosslinker
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Problem bei Arylazid-Photocrosslinkern
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Ketenimin-Bildung
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GFP-Aktivierung
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Prinzip der spaltbaren Linker zur Proteinanreicherung mit Biotin/Avidin
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Prinzip von SILAC
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Prinzip von ICAT
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Quorum-sensing-Botenstoff von gramnegativen Bakterien
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N-Acylhomoserinlacton
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Biotin
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Funktionelle Einheit bei IMAC
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Immobilized Metal Affinity Chromatography
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Titanreagenz zur Phosphoproteinisolierung
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Sanger-Reagenz
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Dansylchlorid
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Hydantoin
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Edman-Abbau
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Größe des menschlichen Genoms
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3900 Mpb, 990 mm
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Watson-Crick-Basenpaarungen
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Prinzip der PCR
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Chemische Synthese von DNA
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DNA-Sequenzierung nach Sanger
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sekundäre Naturstoffe
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Terpene, Aromaten, Alkaloide
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Diagnostic Criteria for Multiple Myeloma
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At least 10% abnormal plasma cells in bone marrow PLUS one of the following:
(1) M-protein in serum [85% of patients]; (2) M-protein in urine [75% of patients]; (3) Lytic bone lesions (well-defined radiolucencies on radiographs - predominantly in skull and axial skeleton) |
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Biosynthese von Fettsäuren
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Mechanismus der Ketosynthase
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Mechanismus der Ketoreduktase
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Mechanismus der Dehydrogenase in der Fettsäuresynthese
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Mechanismus der Enoyl-Reduktase
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