Use LEFT and RIGHT arrow keys to navigate between flashcards;
Use UP and DOWN arrow keys to flip the card;
H to show hint;
A reads text to speech;
32 Cards in this Set
- Front
- Back
|
Ge en överskådlig förklaring på skillnaden på ARTBEGREPP mellan eukaryoter och prokaryoter |
Eukaryoter: •Individer inom samma artkan para sig ochproducera fertilavkomma (Genöverföring sker inom art och varje generation) • Har Sexuell förökning • Genöverföring Prokaryoter: • Okart, andra kriterier – Mer än 97% likhet i16SrRNA genen inomarten – eller mer än 70% totalDNA-sekvens likhet • Ingen sexuell genöverföring • Genöverföring sker, men sällan och mellan arter. |
|
|
Vad är horisontell och vertikal genöverföring? |
Vertikal genöverföring: - (moder-till dotter) den normala nedärvningen Horisontell genöverföring: - Från en cell till en icke-besläktad cell från en annan organismgrupp. Kan ge genöverföring mellan helt skilda arter. (Tänk på hur horisontell genöverföring sprider antibiotikaresistens..) |
|
|
Hur kan genetisk rekombination ske hos asexuella prokaryoter? |
1) Främmande DNA kan komma in i en prokaryot cell via: (alla horisontella) - Transformation: Tar upp löst DNA - Konjugation: Tar upp plasmid - Transduktion: DNA överförs via virus |
|
|
Vad är 1)Exogenote 2) Endogenote 3) Merozygot |
1) Exogenote = inkommande DNA 2) Endogenote = ursprunligt DNA i cellen 3) Merozygot = EN CELL! En variant på zygot där bara en liten del av DNA har olika ursprung |
|
|
Beskriv transformation och peka på skillnader mellan olika system. |
Löst DNA tas in i cellen och används som information. Detta kräver först DNAupptag och sedan homolog rekombinering. Cellen får in ny information. Reparationssystem; skadat DNA som tas upp från samma art kan repareras genom att reparera den skadade genen. Kompetens - förmågan att ta upp DNA - kan hos vissa arter styras va Quorum Sensing Transformation kan ske av linjärt eller cirkulärt DNA (plasmider) |
|
Vad är det för skillnad mellan G+ och G- bakterier vad gäller transformation? |
G+ bakterier: • Icke-specifikt system - kan ta upp allt DNA • DNA binder till DNA-bindande proteiner på cellytan • dsDNA bryts ner till ssDNA som inkorporeras med hjälp av homolog rekombinering G- bakterier: • Fungerar ungefär som G+, men de binder bara DNA från närbesläktade celler med en speciell 8-11bp sekvens • Detta DNA har stor chans att inkorporeras genom homolog rekombinering • En del celler släpper ut DNA som andra kan ta upp (styrs troligen av QS) Bilden är överskådlig, mest för G+ |
|
|
Vilken skulle fördelen vara att reglera kompetens (förmågan att ta upp DNA) genom quorum sensing system? |
Quorom Sensing visar att det är många grannar och att det är bra att ta in liknande DNA (energisnålare) Koncentrationen av molekyler som tar sig lätt igenom membran, hög koncentration = många grannar. |
|
|
Vad är Konjugation? |
Cell-‐cellkontakt Replikation;dvs.detblirtvåplasmider,enigivaren&enimoIagare Mottagarenblirennygivare Plasmidenkodarförallakonjugationsgener Plasmid känner av om det finns på utsidan. Vill ha en LIKARTAD plasmid |
|
|
Vad är en plasmid? |
Plasmider är ringformade DNA-molekyler med omkring 5000 baspar som ofta förekommer i bakterier (prokaryoter). Plasmiden bär ofta en förhållandevis liten mängd information (gener) och kan därmed lätt överföras mellan bakterier. Plasmider som innehåller resistensgener mot antibiotika är ett mycket stort problem inom sjukvården och på längre sikt ett hot mot mänsklig hälsa. Inom molekylärbiologin utnyttjas plasmider vid genkloning. •Flesta cirkulära,men några linjära •En cell kan ha många olika plasmider •En del plasmider fungerar i många olika arter,en del bara i vissa närbesläktade arter F-plasmiden är välstuderad! |
|
|
Vilka "extra-gener" kan plasmider ha? Hur kan de "flytta på sig"? |
"Extra‐gener":antibiotika eller tungmetallresistens, toxin, nedbrytning avkomplexa organiska molekyler m.fl. Har ofta transposoner -IS - och andra "mobila genetiskaelement" |
|
|
Beskriv i detalj mekanismen för Konjugation |
Cell-cell kontakt: Pili; proteinutskott som ger kontakt mellan celler OCH drar ihop cellerna. Olika plasmider har olikatyper av pili Pili kan användas av fagersom attackerar cellen En del plasmider ned-reglerarsina konjugationsgener, bl.a. för att minska risken för virusattack. (Se bilden i josefins block) DNA-metabolism: - Roling circle" DNA syntes: Nick (ssDNA brott) vid OriT, 5' änden fäster i poröppningen mellan givare och mottagare. Ytterligare en Nick sker då OriT kommer tillbaka till poröppningen --> plasmid lossnar - Plasmiden använder cellens egna replikationssytem - Det finns negativ feedback kontroll - ser till att bromsa eller stoppa plasmidreplikation, denna plasmids kontrollsystem - Flera plasmider kan transferera samtidigt |
|
|
Kan det ske konjugation i naturen? |
Ex, GFPfluorescenttransconjugantsfrommatingP.putida(pBF1::gfp)withmarinebacteria |
|
|
Hur regleras generna för konjugation? |
Tra-promotorn behöver genproduktenfrån traJ, Men translation av traJ-mRNAär normalt blockerat av eIler antisenseRNA (FinO protein) från den komplementära strängen somtillsammans med FinO proteinet hybridiserar med traJ.Alltså ingen avläsning avtra.MEN, F‐plasmiden har enmutation i finO genen och konjugationen är konstitutiv (gjorde så att man hittade plasmiden). |
|
|
Vad är inkompatibilitet mellan plasmider? |
Allt för lika mekanismer för replikationskontroll och fördelning. Två olika plasmider ur SAMMA inc. grupp; kopietal 2 plasmider/cell. Innan delning skall plasmiden replikeras så att det blir 2x kopitalet, sedan ska detta fördelas, om den inte "känner skillnad" på plasmiderna blir kopietalet för litet! |
|
|
Hur fungerar mekanismerna för plasmidstabilitet? |
Inkompatibilitet är etthot mot plasmidens nedärvning ”Surface exclusion” reducerar konkurrens genom att likartadeplasmider (från samma inc. grupp) hindras att komma in i cellen ”Host-killing” är ett system medengenför ett toxin (med långlivatmRNA)och en gen (med kortlivatmRNA)för motgift. Om plasmidenförsvinnerur cellen dödas cellen.Förvarmot inkompatibla,konkurrerandeplasmider.(”Plasmidens hämd”) |
|
|
Plasmidstabilitet; Fördelning av R1 plasmidens kopior till dottercellerna (parfunktion). Hur går det till? |
|
|
|
Måste en plasmid ha alla konjugationsfunktioner för att kunna överföras till en ny cell? |
Alla plasmider har inte alla konjugationsgener (tra-gener). De kan istället ha mobiliseringsgener (Mob) som tillåter dem att åka snålskjuts med andra plasmider. |
|
|
Vad är det för speciellt med F-plasmiden? |
Den är den första plasmiden som upptäcktes. Den är välstuderad och är Episom (kan inte integreras i kromosomer), vilket är ovanligt - F-plasmiden är ett specialfall. (F = fertility) Kan "dra med sig" komosomgener när den konjugerar från kromosomen. Användes som en metod för att kartlägga E-coli kromosomer. |
|
|
Vad är en Hrf-cell? |
F-plasmiden kan rekombinera med kromosomen i E-coli via GEMENSAMMA IS element, detta ger en Hrf-cell. |
|
|
Beskriv en Hrf/F-konjugation |
F konjugerar från sin "kromosom-position", till en annan bakterie OBS, OriT ligger mitt i plasmiden; och tra-generna kommer in sister efter hela kromosomen, oftast hinner inte hela över och därför är mottagar-rekombinanten F-. F kan konjugera från olika positioner i kromosomen. |
|
|
Vad är F' (F-prim?) |
Ett specialfall där rekombinering mellan IS i kromosomen (Hrf-cell) bildar en F som får med sig en eller flera närliggande kromosomala gen(er) |
|
|
Hur går rekombination inne i cellen till? |
1. Brott på en eller båda strängarna (här visas dubbelsträngsbrott) 2. Nedbrytning av en av strängarna för att få enkelsträngat DNA (ssDNA) 3. ssDNA "söker upp" homologt DNA 4. Bildar en D-loop bubbla. 5. Överkorsningar, sk. "Holliday junctions" bildas 6. Holliday junctions kan flytta sig längs strängarna 7. Upplösning av Holliday junctions kan resultera i två olika fall |
|
|
Några länkar som du bör titta på! |
Bra video på homolog rekombinering: http://www.youtube.com/watch?v=JOL6YF3Wifs&list=PL43E30E011ECE1A42 Bra video på Holliday junctions och "upplösning" av denna, kolla 1:0 och frammåt (här finns bara EN Holliday junction, men principen är densamma) http://www.youtube.com/watch?v=BhJf9MHHmc4 |
|
|
Vad händer med heteroduplex? |
De sekvenser där endogenote och exogenote inte var exakt lika, kan DNA ha olika sekvenser på olika strängar (heteroduplex). Detta kan lösas på två sätt: Antingen ändras en av strängarna (oftast så att orginalet, endogenotens sekvens blir kvar) så att båda dottercellerna blir samma. Eller, så hinner DNA replikeras och då blir de två DNA kopiorna olika och de två dottercellerna kan alltså bli olika. |
|
|
Vad är transposoner och IS sekvenser? |
IS = Insertion sequenses (har bara gener för trransposition) Tn = Transposoner (har gener för transpotition + andra gener) tnp = transposas gen Inveterted repeat = DNA skvens som är inverterad Tn och IS är "mobila genetiska element", precis som plasmider. IS och Tn sitter ofta på plasmider |
|
|
Beskriv en konservativ transposotion |
Tn går in genom ett litet klipp |
|
|
Beskriv en replikativ transposition |
ds brott på båda - ligeras sedan ihop då ringarna är lösta från varandra |
|
|
Vad är integroner? |
Element med integras som mederar site-specifik rekombinering av s.k. genkassetter som har en 59bp konserverad sekvens MULTIRESISTENS! Integrons are genetic units characterized by their ability to capture and incorporategene cassettes by site-specific recombination. Integrons may be found as part of mobile genetic elements such as plasmids andtransposons. Integrons can also be found in chromosomes. They were initially discovered in relation to antibiotic resistance Som ett lok med vagnar - kan koppla på några vagnar! |
|
|
Varför kan det vara mer fördelaktigt för en bakterie att få nya genfunktioner genom genöverföring än genom mutation? |
Eftersom någon redan testat på genen innan |
|
|
Hur kan man förklara att plasmider finns till? |
|
|
|
Varför finns det bara en del gener på plasmider? |
Plasmidgener är inte nödvändiga för tillväxt eller överlevnad under alla förhållanden De "extra" gener plasmiden bär på är troligen inte "bas" funktioner i cellen, utan är utsatta för selektion periodvis "show me something new" "Betalar hyra" Enkla gensystem som inte behöver koordineras med många andra gener Ex: antibiotikaresistens, tungmetallresistens, nedbrytning av organiska molekyler, virulensfaktorer med mera.. |
|
|
Hur kan multiresistens uppstå? |
Genkoppling - Flera olika antibiotikaresistanser gör att alla blir selekterade om en blir det - Även resistens mot tungmetaller eller desinfektionsmedel finns på plasmider med antibiotikaresistans - Enzymer som ger resistens mot aminoglycosider (ex, streptomycin) kan också ge resistans mot floroquinololer Integroner - Samlar antibiotikaresistans under samma promotor - Multiresistansmekanism |
